ศาลเจ้าฮานาโซโนะจินจา (Hanazono Shrine) ตั้งอยู่ในย่านใจกลางเมืองของชินจูกุ ใกล้กับสถานี Shinjuku 3-chome บนสาย Marunouchi โซเม ศาลเจ้าเล็กๆใจกลางเมือง ที่เงียบสงบ สวยงาม ไม่มีขยะและต้นไม้ได้รับการดูแลอย่างดี เป็นสถานที่ศักดิ์สิทธิ์และเป็นโอเอซิสที่ยอดเยี่ยมสำหรับผู้คน เทพเจ้าสามองค์ที่ประดิษฐานอยู่ที่นี่ ได้แก่ Ukanomitama no Mikoto (ศาลเจ้า Hanazono), Yamato Takeru no Mikoto (ศาลเจ้า Otori) และ Ukemochi no Kami (ศาลเจ้า Raiden) ศาลเจ้าแต่ละแห่งมีแผ่นจารึกของตัวเอง มีประวัติอันยาวนาน และเป็นเทพผู้พิทักษ์ทั่วไปของชินจูกุตั้งแต่ก่อนที่โทคุกาวะ อิเอยาสุจะก่อตั้งเอโดะ (ค.ศ. 1603) และก่อนปี ค.ศ. 1590

มีผู้มากราบไหว้ตลอดเวลาตั้งแต่เช้าและมีนักท่องเที่ยวต่างชาติบ้างเล็กน้อย มักมีเทศกาลใหญ่ในฤดูหนาวและอีกงานหนึ่งในฤดูร้อน เทศกาลในศาลเจ้าแห่งนี้มีผู้คนพลุกพล่าน คึกคัก งานของตลาดโทริโนะอิจิ(Tori no Ichi) จัดขึ้นทุกเดือนพฤศจิกายน จะมีการแสดง Sanbonjime อย่างจริงจังที่นี่ มีแผงขายของมากมายทั้งภายในและภายนอกศาลเจ้า