พิพิธภัณฑ์แห่งชาตินาราก่อตั้งขึ้นในปี 1889 เป็นพิพิธภัณฑ์อิมพีเรียลนารา(帝国奈良博物館 ) พิพิธภัณฑสถานแห่งชาตินาราจัดนิทรรศการครั้งแรกในปีพ. ศ. 2438 เมื่อสมัยก่อนประวัติศาสตร์มีการจัดนิทรรศการนารา ใน 1874 บริษัท นารานิทรรศการของการจัดการกึ่งเอกชนก่อตั้งขึ้นโดยผู้ว่าราชการจังหวัดแล้วนาราFujii Chihiro พิพิธภัณฑ์ได้เปลี่ยนชื่อเป็นพิพิธภัณฑ์บ้านอิมพีเรียลแห่งนารา เป็นที่รู้จักกันในชื่อปัจจุบันตั้งแต่ปี 1952